Scienziati identificano le mappe genetiche delle cellule del tessuto adiposo, scoprendo il loro ruolo nel determinare la suscettibilità all'obesità
In uno studio innovativo pubblicato su Nature Genetics, un team di scienziati guidato da Professor Paivi Pajukanta della David Geffen School of Medicine dell'UCLA ha creato la prima mappa a livello di cellula unica del DNA regolazione e organizzazione nel tessuto adiposo umano. Lo studio, intitolato "Single cell DNA methylome and 3D genome atlas of the human subcutaneous adipose tissue links partitioned polygenic risk of abdominal obesity to SAT cell types", rivela che molti fattori di rischio genetici per l'obesità addominale risiedono in regioni epigenomiche delle cellule adipose.
Lo studio, condotto utilizzando la risorsa UK Biobank, rivela che la maggior parte dei varianti genetiche note collegate all'obesità si trovano in grandi tratti regolatori epigenomici (megabases di lunghezza) dei cromosomi delle cellule adipose. A una risoluzione più fine, queste varianti a rischio di obesità risiedono preferenzialmente in brevi spazi di loci del DNA (centinaia di paia di basi), agendo come manopole per regolare il livello di espressione dei geni essenziali per la funzione degli adipociti.
Sono stati identificati siti regolatori chiave del genoma con geni attivi negli adipociti, come ADIPOQ, LEP e SREBF1. Lo studio dimostra anche che man mano che gli adipociti, le cellule chiave di stoccaggio del grasso, maturano, il loro DNA si riorganizza nello spazio 3D.
La ricerca è stata condotta dai co-primi autori Zeyuan (Johnson) Chen e Sankha Subhra Das, insieme a un team di ricercatori, tra cui Jianhua Chen, Yingying Zhang, Asha Kar, Seung Hyuk T. Lee, Kevin D. Abuhanna, Marcus Alvarez, Mihir G. Sukhatme, Zitian Wang, Kyla Z. Gelev, Matthew G. Heffel, Yi Zhang, Oren Avram, Elior Rahmani, Sriram Sankararaman, Eran Halperin, Chongyuan Luo e diversi altri collaboratori.
Gli autori dello studio non dichiarano conflitti di interessi. La ricerca è stata sostenuta da vari finanziamenti, tra cui i finanziamenti NIH, il Consiglio di ricerca della Finlandia, la Fondazione medica finlandese, la Fondazione Gyllenberg, la Fondazione Novo Nordisk, la Fondazione finlandese per la ricerca sul diabete, la Fondazione Paulo, la Fondazione Sigrid Jusélius, l'Università di Helsinki e l'Ospedale universitario di Helsinki e i fondi di ricerca del governo.
Questa unica mappa epigenomica a livello di cellula unica può avanzare la medicina di precisione facilitando l'identificazione di biomarcatori e terapie specifici degli adipociti per le malattie cardiometaboliche. Gli studi futuri testeranno se la manipolazione dei marchi epigenetici influisce sul comportamento degli adipociti in vitro o nei modelli animali.
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